Vyžuonų seniūnija nuo Utenos nutolusi 12 km į šiaurės vakarus. Plotas: 73 km². Seniūnijos centras - Vyžuonų miestelis.

Seniūnijoje yra 4 seniūnaitijos Antakalnių seniūnaitija, Sprakšių seniūnaitija, Šiaudinių seniūnaitija, Vyžuonų seniūnaitija.